1.ツールオプションでスクリーンを選択。
2.ねこぺ画面内を左クリック(押しっぱなし)
3.左押したままねこぺ画面外へ持っていくと色が拾える

これを使うと他の画像やウェブページと色を合わせたりできます。

・すべてのレイヤー：普通のモード。ねこぺで開いている画像から色を拾います。
・アクティブレイヤー：現在のレイヤーのみから色を拾います。
・スクリーン：ねこぺ画面の外からも色を拾えます。

・色が拾えない
　ツールオプションが"アクティブレイヤー"になっていると見えている色でも拾えなかったりします。バグではありません。(現在のレイヤーだけを対象にするので)
とりあえずモードを"スクリーン"にしておくと使いやすいと思います。